Ventilatoren er den eneste-energiforbrugende komponent i luftbehandlingsenheden. I lighed med generelle blæsere skal den passende blæsertype vælges ved bestilling baseret på forholdet mellem luftstrøm og trykhøjde, såsom fremad-buede eller bagudbuede-vinger, for at sikre optimal støj og effektivitet. I de senere år har aerofolieventilatorer importeret fra udlandet vist høj effektivitet.
Med udviklingen af computerteknologi og forbedring af automatiske kontrolniveauer bliver systemer med variabel luftvolumen (VAV) i stigende grad brugt i kontorbygninger, renrum, hospitaler og andre miljøer, hvilket stiller nye og højere krav til valget af indblæsnings- og returluftventilatorer i luftbehandlingsanlæg. For det første skal ventilatorens karakteristiske kurve have en jævn kurve, så systemet undgår unødvendige statiske trykstigninger, når luftstrømmen falder. For det andet skal den valgte ventilator fungere inden for et relativt stabilt, høj-effektivitetsområde. For det tredje bør retur-/udsugningsventilatorerne være af samme model eller type som indblæsningsventilatorerne og have lignende ydelsesegenskaber for at sikre en effektiv afstemning af hele systemet under drift.
